Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 UBE2CP1-201ENST00000557130 554 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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