Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL4A6Q14031 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL4A6Q14031 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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