Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CACNA1SQ13698 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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