Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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AP3B2Q13367 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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AP3B2Q13367 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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AP3B2Q13367 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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AP3B2Q13367 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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AP3B2Q13367 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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AP3B2Q13367 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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AP3B2Q13367 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AP3B2Q13367 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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