Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ITGB3BPQ13352 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ITGB3BPQ13352 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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