Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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