Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXD4Q12950 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXD4Q12950 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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