Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CENPFP49454 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CENPFP49454 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms