Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
HOXA13P31271 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA13P31271 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms