Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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PTPRAP18433 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRAP18433 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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