Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
CCDC93Q567U6 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms