Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC96Q2M329 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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CCDC96Q2M329 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
CCDC96Q2M329 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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