Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC106799.2-201ENST00000507435 721 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005176.1-203ENST00000597077 532 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR197-201ENST00000384976 75 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 HIST1H2BPS2-201ENST00000402707 340 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC00160-201ENST00000430635 693 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CCNJP1-201ENST00000450600 1149 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IGLVI-70-201ENST00000523272 390 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC012574.1-201ENST00000523874 252 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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