Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RASGEF1BQ0VAM2 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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