Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TTPAP49638 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TTPAP49638 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.6 ms