Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
ERVV-2B6SEH9 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms