Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COPS7AQ9UBW8 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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