Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NRF1Q16656 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NRF1Q16656 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms