Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.7 ms