Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRRQ15256 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms