Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RFTN1Q14699 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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