Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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