Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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FOXF1Q12946 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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FOXF1Q12946 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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FOXF1Q12946 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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FOXF1Q12946 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXF1Q12946 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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