Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ERVV-1B6SEH8 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms