Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
IMPG1Q17R60 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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