Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DEFB4A-201ENST00000302247 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SDHC-204ENST00000432287 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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FXNQ16595 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PWRN1-212ENST00000569908 1435 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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