Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 HSPA8P11-201ENST00000508840 1898 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
CCDC85BQ15834 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CCDC85BQ15834 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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