Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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TCIRG1Q13488 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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