Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 IL22RA2-203ENST00000349184 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ACACAQ13085 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms