Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTP4A2Q12974 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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