Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.6 ms