Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm3550W4VSN7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm3550W4VSN7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms