Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn6Q9Z262 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms