Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sh2d3cQ9QZS8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms