Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ercc4Q9QZD4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms