Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms