Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms