Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vstm2bQ9JME9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vstm2bQ9JME9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms