Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf1Q9JM58 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf1Q9JM58 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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