Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tuba8Q9JJZ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tuba8Q9JJZ2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms