Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hspb11Q9D6H2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hspb11Q9D6H2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms