Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Shisa9Q9CZN4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms