Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms