Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gtpbp4Q99ME9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms