Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRF1Q92994 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRF1Q92994 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms