Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrif1Q923B3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrif1Q923B3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms