Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApobrQ8VBT6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApobrQ8VBT6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms