Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Otud6bQ8K2H2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms