Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkiras1Q8CEC5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkiras1Q8CEC5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms