Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc49a3Q8CE47 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc49a3Q8CE47 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms